本所之教育目標乃依據院訂教育目標及參考AC2014規範，並經所務會議、認證推行小組及諮詢委員會討論後制訂。本所博士班包含化學及材料工程組、資訊工程組、電機電子工程組、環境資訊及工程組、動力及系統工程組、機械及航太工程組等六個組，主要在培養具備化工及材料、資訊工程、電機電子工程、環境資訊及工程、動力及系統工程、機械及航太工程相關國防科技專業素養之領導研發人才，及培育相關專長之軍事(民間)院校師資。
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